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内设机构21个:办公室(党委办公室)、人事处(离退休人员办公室)、财务资产处、条件保障处、业务管理处、信息处、科技与国际合作处(研究生处)、标准处、质量监督处、化药评审处、生药评审处、实验室管理处、细菌制品检测一室、细菌制品检测二室、病毒制品检测一室、病毒制品检测二室、动物试验室、菌种保藏与检测室、化学药品检测室、安全评价室、兽医器械检测室。